狗狗晚上为什么低吼？
首先，说明一下，狗没有所谓的“夜晚恐惧症”！ 所谓的“害怕黑夜”、“害怕黑暗环境”，都是人类的主观猜测 （ps：其实，在人类已经能够控制光源的白天和人工照明灯火通明的现代，犬科动物也依旧会担心人类突然袭击，因此会在白天也会提高警惕、随时做出防御反应）。
其次，来分析一下题主描述的“半夜醒来看到它在那里坐着，然后看着我，眼神很恐怖，感觉就像看到了敌人一样。然后我故意走过去吓它，它立刻逃走了……” 根据你的描述，那只狗狗应该不是你的宠物狗，而是野生的流浪狗。
一、对于野生流浪犬来说，夜间（尤其是凌晨）是它们寻找食物、准备捕猎的时间段 二、对于尚未驯化的狼犬等犬科动物而言，人类是一个威胁，一个需要警惕的“危险动物” 三、人夜行，提着一盏灯或者手电筒，对犬科动物来说是十分可疑的行为——它们不知道你是要伤害它还是要帮助它 四、你提到的“我故意走过去吓它，它立刻……逃走了”，我认为这是狗的本能反应，而非“看见陌生人而感到害怕”所导致的。
综上分析，我认为导致你家狗狗半夜坐立不安、频频低吼的原因在于： 它认为有人在夜里偷袭它，因而时刻处于戒备状态； 同时，由于未知原因（可能只是你开灯收拾了碗筷）使它认为主人安全受到威胁，进而发出警告性鸣叫（嚎叫），提醒主人注意，并准备发起进攻（捕猎）。